Isa pang genomic tool para sa pagpapabuti ng laki ng magkalat
Dr. Chunyan Zhang, Phd, Genetician Genesus Inc.
Ang sukat ng litter ay isang napakahalagang kadahilanan na nagpapasiya sa pagtatanim ng tubo. Ang isang pangunahing limitasyon para sa pagtaas ng laki ng mga biik ay embryonic pagkawala na nangyayari sa panahon ng 2nd na 3rd linggo ng pagbubuntis (Geisert at Schmitt, 2002, J Anim Sci. 80, E54-E65).
Maraming mga kadahilanan ay maaaring magbigay ng kontribusyon sa na ito ng timbang at isang posibleng dahilan ng maagang embryonic dami ng namamatay ay maaaring ang pagkakaroon ng ilang mga mapanganib na mga alleles (iba't ibang porma ng isang gene) para sa mahahalagang mga gene na humahantong sa pangsanggol kamatayan sa ilang sandali lamang matapos ang isang babaeng nabuntis. Ang dalas ng mga mapanganib na alleles na ito ay maaaring mabawasan sa isang populasyon pagkatapos ng pang-matagalang pagpili para sa malalaking sukat ng lagari, tulad ng sa mga maternal breed. Gayunpaman, sa mga breed na hindi napili para sa mas mataas na laki ng lagayan (hal. Duroc), ang mga mapanganib na mga alleles na ito ay maaaring hindi pinansin (o nakatago) at sa isang mas mataas na dalas kumpara sa na sa mga napiling populasyon.
Kadalasan ang mga mapanganib na alleles na ito ay nagiging sanhi ng mamatay ng sanggol kapag sila ay nasa homozygous na estado (tinatawag na recessive, isang mapanganib na kopya mula sa bawat magulang, hal. Aa). Kapag naroroon sila sa heterozygous state (ang mga alleles na minana mula sa dam at sire ay iba, tulad ng Aa), ang indibidwal ay nabubuhay at normal na phenotypically. Ang heterozygous na hayop na ito, na kilala bilang isang carrier ay napakahirap kilalanin at sa gayon ay patuloy na makakalat ang nakakapinsalang alleles sa populasyon.
Genomic teknolohiya ngayon ay nagbibigay ng isang state-of-the-art na diskarte sa tiktikan tulad mapanganib na allele na inaasahan na maging relatibong karaniwan sa isang hindi nakapili populasyon ngunit hindi kailanman mangyayari sa recessive homozygote estado sa live na mga hayop. Ang diskarte na ito ay nangangailangan lamang ng data ng genotype sa phenotypically normal (ie live) na indibidwal upang makita ang nakakapinsalang alleles sa pamamagitan ng statistical analysis. diskarte na ito ay una na ginagamit sa pagawaan ng gatas baka at napansin alleles kaugnay sa pagkamayabong defects (VanRaden et al., 2011, J Dairy Sci. 94, 6153-6161). Higit pang mga kamakailan-lamang na pag-aaral ay nagsimula upang tumingin sa mga baboy at natagpuan ng ilang mga allele na nauugnay sa mas maliit na mga litters at higit pa patay nang isilang piglets sa dam linya at / o komersyal na mga linya (Häggman at Uimari, 2017, J Anim Breed Genet 134, 129-135;. Howard et al ., 2017, GSE 49, 57; Derks et al., 2017, BMC Genomics 18, 858).
Sa Genesus genomic database, mayroon kaming libu-libong mga baboy na may impormasyon na data ng genotype (60K, 80K, 650K at lapad ng pagkakasunud-sunod) na nagbibigay-daan sa amin upang maghanap para sa mga potensyal na mapanganib na mga alel na nauugnay sa laki ng basura, at karagdagang tantyahin ang kanilang mga epekto sa pagkamayabong ng baboy sa pamamagitan ng aming malaking hanay ng mga phenotypes. Ang aming paunang pagsisikap na nakatuon sa Duroc boars gamit ang 650K SNP genotypes. Maraming mga rehiyon ng genome ang natagpuan na potensyal na magkaroon ng mapanganib na mga alel. Bilang isang halimbawa, para sa pinaka-makabuluhang SNP hinulaan namin na dapat mayroong 45 homozygous recessive (aa) na mga indibidwal ngunit wala namang sinusunod. Ang rehiyon na naglalaman ng SNP na ito ay makabuluhang nauugnay sa higit na mga mummified fetus (P <0.001).
Kung ikukumpara sa mga naunang ulat sa mga baboy (tingnan sa itaas), ang mga kilalang genomic na rehiyon ay tila medyo lahi o tiyak na populasyon, bagama't nakita namin ang ilang mga rehiyon na maaaring magkasabay sa nakaraang mga natuklasan.
Ang mga natuklasan na ito ay nagbibigay ng mahalagang impormasyon upang potensyal na madagdagan ang laki ng laki sa populasyon ng Genesus Duroc. Ito ay hahantong sa hindi lamang ng maraming mga baboy na ginawa ngunit nadagdagan ang pagpapabuti ng genetiko sa pamamagitan ng mas mataas na intensidad ng pagpili. Ang mga diskarte para sa pagbawas ng dalas ng mga nakakapinsalang alleles ay kinabibilangan ng genomic selection at genomic-based na mga plano sa pakikipagtalastasan gamit ang Genesus custom SNP chip.
Ang pagpapatupad ng naturang mga natuklasan sa pananaliksik ay makabuluhang magbibigay ng kontribusyon sa layunin ng Genesus ng pagtaas ng halaga at kakayahang kumita para sa mga customer ng Genesus.
Nakategorya sa: Tampok na Balita, Global Tech
Ang post na ito ay isinulat ni Genesus