Integridad ng Data at Mga Genetic Evaluation System

Ni: Everestus Akanno, PhD., Geneticist, Genesus Inc.

Ang tagumpay ng mga programa sa pagpapabuti ng genetiko ng baboy ay nakasalalay nang labis sa patuloy na pagbuo, koleksyon, at pagtatasa ng buong data ng industriya mula sa parehong mga setting ng nucleus at komersyal.

Ang data na ito ay nagmula sa iba't ibang mga mapagkukunan kabilang ang mga pasilidad sa pagsubok ng mga supling, pag-iimpake ng mga halaman, nukleus at komersyal na kamalig, at mga laboratoryo ng DNA (Larawan 1) na karaniwang nailalarawan ng isang mabilis na kapaligiran sa pagtatrabaho kung saan ang pagbuo ng data at koleksyon ay nangyayari nang mabilis at tuloy-tuloy at ang mga tao ay maaaring walang katumpakan ng data bilang kanilang pangunahing priyoridad, sa gayon, lumilikha ng silid para sa mga posibleng pagkakamali. Bilang karagdagan, ang mga pagsulong sa teknolohiya at pagkalkula ay pinapayagan para sa awtomatiko ng pagbuo ng data at pagsasama sa isang remote database na maaaring mabawasan ang mga potensyal na error. Gayunpaman, mayroon pa ring mga katanungan sa kalidad at bisa ng buong data ng industriya para sa paghahambing ng mga cohort, pagsusuri ng merito sa genetiko, at paggawa ng mga desisyon sa pagpili.

Ano ang integridad ng data?

Sa konteksto ng mga programa sa pagpapabuti ng genetiko, ang integridad ng data ay tinukoy bilang ang lawak kung saan nakolekta ang data sa isang indibidwal ay kumpleto, pare-pareho, tumpak at maaasahan para sa mga hangaring genetika sa pagsusuri. Ayon sa mga patnubay na ibinigay ng International Council on Animal Recording (ICAR, 2018), ang isang kumpleto at tumpak na tala sa isang hayop ay dapat magkaroon ng mga sumusunod na katangian:

Pagkilala sa hayop - Ang hayop ay dapat na makilala nang maayos gamit ang anumang naaangkop na pamamaraan ng pagkakakilanlan.
Pag-verify ng magulang - Ang pagiging magulang ng indibidwal ay dapat na ma-verify at masusubaybayan.
Mga petsa ng pagrekord - Ang mga petsa ng kapanganakan at mga petsa ng pagsukat ay dapat na kumpleto at tumpak.
Mga halagang Phenotypic - Ang halaga ng tala ng hayop ng produksyon o antas ng pagganap ay dapat na nasa loob ng pinapayagan na nai-publish na mga baseline para sa mga ugali at lahi.
Mga sistematikong epekto - Ang mga kadahilanan na kilalang nauugnay sa tala ng pagganap para sa isang indibidwal ay dapat pansinin at maayos na idokumento.

Mga isyu na may integridad ng data sa paggawa ng baboy

Ang pagkolekta ng data at interpretasyon ang bumubuo ng pundasyon para sa maraming mga desisyon na ginawa sa industriya ng baboy. Ang pagbuo ng makabuluhang halaga ng data ay naging isang normal na bahagi ng negosyong pagpapabuti ng genetiko ng baboy, lalo na sa pagkakaroon ng teknolohiyang genomic. Gayunpaman, ang mga pagkakamali ng tao at pagkabigo ng mga awtomatikong system ay maaaring ikompromiso ang integridad ng data. Ang mga halimbawa ng mga potensyal na isyu sa integridad ng data ay nagsasama ngunit hindi limitado sa mga sumusunod:

Maling maling pagbebenta ng mga sample (hal. Para sa mga layuning genotyping).
Hindi magandang paghawak ng mga sample sa panahon ng pag-iimbak na maaaring magresulta sa nawawalang data.
Maling pagkilala sa hayop.
Maling pagtatalaga ng magulang.
Error sa pagpasok ng data.
Pagkabigo sa mga awtomatikong sistema ng pagsukat na humahantong sa hindi tumpak na mga sukat o pahinga sa mga inorasang pagsukat (hal. Mga indibidwal na kagamitan sa paggamit ng feed).
Hindi tumpak na pagrekord ng ultrasound mula sa mga walang karanasan o hindi sanay na mga tekniko

Ang mga pagsisikap na pagaanin ang mga isyung ito ay malayo pa upang mapabuti ang kalidad at integridad ng data na ginamit para sa pagsusuri ng genetiko, sa gayon, na hahantong sa mas tumpak na pagtantiya ng merito sa genetiko.

Mga hakbang upang mapabuti ang integridad ng data sa mga sistemang pagsusuri ng genetiko

Tulad ng naunang nabanggit, ang mga pagkakamali sa pagtatalaga ng magulang at sa pag-uugnay ng data (genotype o phenotype) sa tamang mga hayop sa sistema ng pagrekord ay maaaring maging lubhang mapanganib at mapahina ang mahuhulaan na kapangyarihan ng sistemang pagsusuri ng genetiko. Ang pinakamahalagang susi sa integridad ng data ay ang mga tao. Ang mga tauhan na mayroong masidhing interes at pag-unawa sa kahalagahan ng kalidad ng data ay ang pinakamahalagang mapagkukunan upang matiyak ang integridad ng data. Samakatuwid, ang integridad ng data ay kailangang subaybayan sa pamamagitan ng masusing pagtingin sa mga sumusunod na lugar:

Ang data mula sa iba`t ibang mga mapagkukunan ay kailangang ma-verify at interrogated bago isama sa database.
Lahat ng software na sumusuporta sa pagkolekta ng data, pagproseso ng data at pag-uulat ng data ay kailangang regular na mapatunayan.
Ang pag-access sa database ay dapat na higpitan sa mga indibidwal na responsable para sa koleksyon at pamamahala ng data.
Ang lahat ng mga taong kasangkot sa pagkolekta ng data at pagtatasa ay dapat sanayin at mapanatili ang sertipikasyon, kung naaangkop.
Ang mga hakbang sa pagkontrol sa kalidad ay dapat na nasa lugar at awtomatiko upang makilala ang mga potensyal na error sa pagpasok ng data.
Ang paggamit ng data at pag-aaral ay dapat na may kasamang mga hakbang para sa pagkilala, pagpapakita, at pag-filter ng maling data.

Bilang isang nangungunang pandaigdigang kumpanya ng henetikong baboy, sineseryoso ng Genesus Inc. ang integridad ng data. Isinasaalang-alang ng aming nakatuong kawani ang integridad ng data bilang pinakamataas na priyoridad. Patuloy naming sinusubaybayan ang integridad ng data at nagtaguyod ng mga hakbang para sa pagkilala at pagbubukod ng maling data mula sa pagpasok sa database. Bilang karagdagan, ang Genesus Genetic Team ay patuloy na nagsasaliksik at nagkakaroon ng mga diskarte sa nobela para sa pagpapabuti ng kalidad ng data na ginamit sa pagtantya ng genetiko na merito, sa gayon, naghahatid ng pinakamahusay na genetika sa aming mga customer.