データの完全性と遺伝的評価システム

投稿者：Everestus Akanno、PhD。、Geneticist、Genesus Inc.

豚の遺伝的改善プログラムの成功は、核と商業の両方の設定からの業界全体のデータの継続的な生成、収集、および分析に大きく依存しています。

これらのデータは、子孫試験施設、梱包工場、核および商業用納屋、DNA研究所（図1）などのさまざまなソースから取得されます。これらは通常、データの生成と収集が迅速かつ継続的に行われるペースの速い作業環境を特徴としています。人々はデータの正確さを最優先事項として持っていない可能性があるため、エラーが発生する可能性があります。さらに、テクノロジーと計算の進歩により、データ生成の自動化とリモートデータベースへの統合が可能になり、潜在的なエラーを減らすことができます。それにもかかわらず、コホートの比較、遺伝的メリットの評価、および選択の決定を行うための業界全体のデータの品質と妥当性については、依然として疑問が残ります。

データの整合性とは何ですか？

遺伝的改善プログラムの文脈では、データの完全性は、個人に関して収集されたデータが、遺伝的評価の目的で完全で、一貫性があり、正確で、信頼できる程度として定義されます。動物記録に関する国際評議会（ICAR、2018）によって提供されたガイドラインによると、動物に関する完全で正確な記録には、次の属性が必要です。

動物の識別–動物は、適切な識別方法を使用して適切に識別される必要があります。
親子関係の確認–個人の親子関係を確認し、追跡できるようにする必要があります。
記録日–生年月日と測定日は完全かつ正確である必要があります。
表現型の値–生産またはパフォーマンスレベルの動物記録の値は、特性および品種について公開されている許容ベースライン内にある必要があります。
体系的な影響–個人のパフォーマンスの記録に関連することがわかっている要因を記録し、適切に文書化する必要があります。

豚の生産におけるデータの完全性に関する問題

データの収集と解釈は、養豚業界で行われる多くの決定の基盤を形成します。大量のデータの生成は、特にゲノム技術の出現により、ブタの遺伝子改良ビジネスの通常の部分になりました。ただし、人為的エラーや自動システムの障害により、データの整合性が損なわれる可能性があります。データの整合性に関する潜在的な問題の例には、以下が含まれますが、これらに限定されません。

サンプルの誤ったラベル付け（例えば、ジェノタイピングの目的で）。
保存中のサンプルの取り扱いが不十分で、データが失われる可能性があります。
動物の識別が正しくありません。
親子関係の誤った割り当て。
データ入力エラー。
自動測定システムの故障により、測定が不正確になったり、時間測定が中断したりします（例：個々の飼料摂取装置）。
経験の浅いまたは訓練を受けていない技術者からの不正確な超音波記録

これらの問題を軽減するための努力は、遺伝的評価に使用されるデータの品質と完全性を改善するのに大いに役立ち、したがって、遺伝的メリットのより正確な推定につながります。

遺伝子評価システムにおけるデータの完全性を改善するための措置

前に述べたように、親子関係の割り当てや記録システム内の適切な動物へのデータ（遺伝子型または表現型）のリンクの誤りは非常に悲惨であり、遺伝的評価システムの予測力を損なう可能性があります。データの整合性にとって最も重要な鍵は人です。品質データの重要性に強い関心と理解を持っているスタッフは、データの整合性を確保するための最も貴重なリソースです。したがって、次の領域を注意深く監視して、データの整合性を頻繁に監視する必要があります。

データベースに統合する前に、さまざまなソースからのデータを検証して調査する必要があります。
データ収集、データ処理、およびデータレポートをサポートするすべてのソフトウェアは、定期的に検証する必要があります。
データベースへのアクセスは、データの収集と管理を担当する個人に制限する必要があります。
データの収集と分析に関与するすべての人は、必要に応じてトレーニングを受け、認定を維持する必要があります。
データ入力の潜在的なエラーを特定するために、品質管理措置を実施し、自動化する必要があります。
データの使用と分析には、誤ったデータを特定、視覚化、およびフィルタリングするための手順を含める必要があります。

Genesus Inc.は、世界をリードする豚の遺伝子会社として、データの整合性を非常に重要視しています。当社の専任スタッフは、データの整合性を最優先事項と考えています。データの整合性を継続的に監視し、誤ったデータを特定してデータベースへの入力から除外するための対策を確立しています。さらに、Genesus Genetic Teamは、遺伝的メリットの推定に使用されるデータの品質を改善するための新しいアプローチを継続的に研究および開発しているため、お客様に最高の遺伝学を提供します。