Consanguinité: Pas tous la tristesse et la mort

Pius B. Mwansa, PhD, Genesus Inc.

En tant que processus, l'accouplement d'individus apparentés est défini comme une consanguinité.

Strictement parlant, tous les animaux d'une race ou d'une population sont apparentés puisque la plupart des races ont été fondées par un petit nombre d'animaux. Cependant, en pratique, la consanguinité est considérée comme l'accouplement d'animaux qui sont plus étroitement apparentés que la moyenne de la race.

La mesure standard de la consanguinité est appelée le coefficient de consanguinité. Les méthodes d'estimation de la relation entre deux individus et donc le coefficient de consanguinité d'un individu sont bien documentés à partir de 1920 avec Wright (http://www.esp.org/foundations/genetics/classical/holdings/w/SW-v6-n2-p111-io.pdf; consulté mars 21, 2018).

Le coefficient de consanguinité (F) mesure la probabilité de gènes identiques à n'importe quel locus chez un individu. Il y a deux composantes au coefficient, l'une dépend du nombre de liens généalogiques communs aux parents d'un individu par l'intermédiaire d'un ancêtre commun et le second est le coefficient de consanguinité de l'ancêtre commun. Ensemble, ils forment le coefficient de consanguinité de l'individu. Pour plus de détails sur le calcul du coefficient de consanguinité, voir (http://www.nsif.com/Factsheets/nsif4.pdf).

Une préoccupation avec la consanguinité est la réduction des performances avec des niveaux élevés de consanguinité. Cette réduction varie selon les traits ou les groupes de traits. La dépression des traits de performance reproductrice est bien documentée, mais la dépression de consanguinité a également un impact sur d'autres traits (Kock et al.2009, https://www.arch-anim-breed.net/52/51/2009/aab-52-51-2009.pdf, consulté March 23, 2018; http://www.nsif.com/Factsheets/nsif4.pdf).

IEn général, plus le degré de consanguinité est élevé, plus la réduction des performances est importante. Cependant, il est important de noter que cet effet est observé à des niveaux de consanguinité beaucoup plus élevés que ceux que l'on trouve couramment dans les races porcines actuelles et certainement bien au-delà de ce qui est considéré comme acceptable dans les programmes modernes d'amélioration génétique. Il est également important de se rappeler que l'effet essentiellement opposé de la consanguinité est l'hétérosis, qui fournit une augmentation des performances résultant du croisement d'animaux de différentes races. Par conséquent, cet effet de consanguinité est peu préoccupant dans l'industrie porcine commerciale.

Les programmes de sélection utilisent des valeurs d'élevage estimées, ce qui tend à identifier les animaux qui sont plus apparentés parce qu'ils ont tendance à partager plus de gènes associés à une valeur génétique supérieure. L'augmentation de la valeur génétique des candidats à la sélection favorise l'amélioration génétique. Par conséquent, à cet égard, la consanguinité n'est pas une mauvaise chose mais doit être gérée. Un facteur influant sur le taux d'amélioration génétique est la quantité de variation génétique dans une population. Une consanguinité accrue entraîne une diminution de la variation génétique et a un impact négatif sur le gain génétique. Les stratégies d'accouplement qui contrôlent la consanguinité tout en maximisant le taux d'amélioration génétique sont un élément de base dans les programmes d'élevage modernes.

Aujourd'hui, l'utilisation courante des données génomiques dans les programmes de sélection porcine offre davantage d'opportunités pour améliorer l'estimation et la gestion de la consanguinité. Lors du récent Congrès mondial sur la génétique appliquée à la production animale (http://wcgalp.com/wcgalp18) plusieurs articles ont porté sur l'utilisation de l'information génomique pour aider à gérer la consanguinité dans les programmes d'amélioration génétique. Genesus contrôle la consanguinité en utilisant des stratégies d'accouplement planifiées et des programmes de sélection qui optimisent le taux d'amélioration génétique. Les programmes actuels d'amélioration génétique de Genesus visent à aider nos clients à maximiser leur rentabilité.

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