Outils génomiques pour traiter la pureté des races et optimiser l'hétérosis dans la production porcine
Everestus Akanno, PhD, généticien, Genesus Inc.
Les programmes d’amélioration génétique porcine sont concentrés dans les troupeaux de base qui conservent une ou plusieurs races ou composites dans le but d’améliorer les performances des porcs croisés dans les troupeaux commerciaux.
Par conséquent, la pureté 100% de la race est supposée basée sur des enregistrements généalogiques et des caractéristiques largement subjectives de la race telles que la couleur des cheveux, la longueur de l’oreille et la structure. Cependant, des erreurs d’élevage et d’enregistrement peuvent se produire, susceptibles de générer des erreurs d’élevage et de généalogie. Ainsi, l'utilisation de caractéristiques de race connues n'est pas assez fiable pour prendre une décision finale. De nouvelles méthodes et technologies, notamment celles liées à la génomique, doivent être développées, personnalisées et mises en œuvre pour améliorer les programmes d’amélioration génétique.
Actuellement, des outils génomiques tels que Polymorphismes Mononucléotidiques (SNP) sont utilisés avec les informations sur les performances et le pedigree pour la prédiction génomique des valeurs d'élevage et, par la suite, la sélection génomique dans les troupeaux de porcs du noyau.
En plus de la sélection génomique, ces outils génomiques (SNP) peuvent être utilisés pour la vérification de la généalogie et de la race des porcs (Kuehn et al., 2011 J. Anim. Sci. 89: 1742 – 1750. Doi: 10.2527 / jas.2010 -3530. PMID: 21278116).
Les porcs dont l'attribution de race est incorrecte peuvent être identifiés et corrigés, garantissant ainsi la pureté de la race et des systèmes d'enregistrement.
En outre, la validation de la composition de la race est bénéfique pour les programmes de croisement afin d’assurer le maximum d’avantages de l’hétérosis et de la complémentarité des races. Ceci est particulièrement important pour les producteurs commerciaux car des programmes de croisement corrects contribuent largement à la rentabilité des troupeaux commerciaux.
Des recherches approfondies ont été menées sur l'utilité des outils génomiques pour la détermination de la composition des races chez le bétail (Akanno et al., 2017 Can. J. Anim. Sci. 97: 431 – 438, dx.doi.org/10.1139/cjas- 2016-0124; Mujibi et al., 2018, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0190080). Les résultats de ces études suggèrent que la composition de la race d'un animal peut être déterminée avec une précision allant jusqu'à 96 en utilisant des marqueurs génomiques (Akanno et al., 2017).
Genesus a déjà développé et intégré un système complet et automatisé de vérification des généalogies dans son évaluation génomique hebdomadaire. Nous améliorerons ce système en incluant des procédures de vérification de la composition des races pour garantir davantage la qualité des populations de noyau de race pure Genesus. Ces procédures seront développées en personnalisant les logiciels existants pour nos populations de race pure et en incorporant notre panel SNP personnalisé. (plus de 55k polymorphismes nucléotidiques uniques)
Le programme d’amélioration génétique de Genesus Inc. vise à aider nos clients à optimiser leur rentabilité. Nos efforts continus pour assurer la qualité et l'exactitude de toutes les données constituent un élément important de ce programme. Des pedigrees précis et la pureté de la race ont un impact sur le programme de nombreuses manières et donc sur le succès de nos clients.
En tant que société leader sur le marché de la génétique porcine, Genesus Inc. développe et applique en permanence de nouvelles technologies et méthodes, garantissant ainsi la meilleure génétique à tous ses clients.
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Cette publication a été écrite par Genesus