Index de sélection - Possibilités à l'ère de la génomique
Dr. Dinesh Thekkoot PhD, Génétique des gènes
La sélection est le processus par lequel nous choisissons les animaux qui deviendront les parents de la prochaine génération, et nous le faisons depuis la domestication. La question importante n'est pas de savoir si la sélection est pratiquée mais quel est le but de la sélection. Dans l'industrie porcine d'aujourd'hui, l'objectif doit être de maximiser les profits. Par conséquent, identifier le ou les meilleurs animaux qui maximisent le profit est la partie clé du processus de sélection
Les systèmes de sélection traditionnels exigent l'enregistrement de la filiation et des tests de performance de nombreux porcs pour des traits multiples à différents stades de la vie et dans de multiples environnements / emplacements. Ce processus prend beaucoup de temps et a d'importantes implications économiques. Avec le progrès récent dans les technologies et les méthodes génomiques, il est maintenant possible de surmonter beaucoup de ces restrictions. Les applications génomiques offrent des possibilités de collecter de nouvelles informations / traits plus détaillés et complexes auprès d'une population plus large de porcs. Ceci, avec d'autres facteurs comme une meilleure compréhension de la biologie animale, le développement de nouvelles technologies de détection / enregistrement, etc. nous permet de définir et de mesurer de nouveaux caractères et d'améliorer les traits courants utilisés dans les index de sélection.
Les traits d'index actuels qui bénéficient le plus de ces nouvelles technologies:
Traits de santé et de forme physique: C'est un domaine qui a grandement bénéficié des progrès de la génomique et des technologies connexes. Par exemple, le SDRP et le DEP sont des maladies économiquement importantes qui affectent l'industrie porcine dans le monde. Alors que les mesures de vaccination et de biosécurité ont joué un rôle important dans le contrôle des flambées de maladies, la variabilité et le caractère infectieux des souches virales ont entravé l'efficacité de ces étapes. Les producteurs sont également confrontés à une pression croissante de la part des consommateurs et des organismes de réglementation pour réduire l'utilisation d'antibiotiques et assurer un meilleur bien-être animal. Ces facteurs, ainsi que les coûts accrus associés à une productivité réduite et à une augmentation des coûts de main-d'œuvre et de médecine vétérinaire, obligent les organisations à inclure les traits de santé dans l'indice de sélection. Les progrès de la génomique offrent des opportunités plus efficaces pour inclure ces caractères dans les indices de sélection. Genesus a commencé à mettre cela en œuvre et utilise un marqueur de polymorphisme nucléotidique unique (SNP) associé à la tolérance à la maladie du SDRP dans le processus de sélection.
Caractères de qualité de la carcasse et de la viande: Genesus s'engage à améliorer la qualité de la carcasse et de la viande. Depuis 1998, Genesus a mené un programme hebdomadaire d'analyse de la qualité des carcasses et de la viande et a inclus ces caractères dans le processus de sélection. Pour cette raison, les porcs Genesus continuent d'exceller dans les qualités de carcasse, de viande et de qualité alimentaire. L'intégration de la génomique dans le programme de sélection nous a aidés à améliorer ces caractères de manière plus efficace et efficiente. Par exemple, les précisions de la valeur d'élevage estimée (EBV) ont augmenté en moyenne de 76% pour les caractères de qualité de la viande (couleur, persillage, pH, etc.) et de 137% pour les caractères de carcasse (lard de la carcasse, longe de carcasse et poids de la carcasse chaude).
Caractéristiques de la consommation alimentaire: Genesus enregistre depuis de nombreuses années la consommation alimentaire croissante des porcs et des truies en lactation et l'utilise dans le programme de sélection. Encore une fois, l'incorporation de la génomique et des technologies d'enregistrement automatisé augmente les précisions EBV de plus de 30%, augmentant ainsi le taux d'amélioration génétique.
Croissance et traits de reproduction: Nos études pour valider l'augmentation des précisions EBV intégrant des informations génomiques ont montré que, les précisions moyennes de prédiction pour les caractères de croissance (âge à 120 kg, lombaire et profondeur du rein, etc.) ont augmenté de 47%, 101% 60% pour Yorkshire, Landrace et Durocs respectivement. De même, l'utilisation de la génomique a augmenté la précision de l'EBV pour le total des nés de plus de 100% dans les populations du Yorkshire et de Landrace. Ces augmentations de précision se traduisent par une amélioration de la réponse génétique et de la rentabilité des clients Genesus.
Nouveaux traits qui peuvent être ajoutés à l'avenir:
L'amélioration génétique doit se concentrer sur les porcs croisés élevés dans des troupeaux de production commerciale. L'utilisation de la génomique aidera à ajouter des informations provenant d'animaux croisés dans des troupeaux commerciaux à l'évaluation des animaux de race pure dans un troupeau noyau. Actuellement, Genesus mène un vaste projet de recherche en collaboration avec l'Université de l'Alberta et l'Université d'État de l'Iowa pour déterminer les avantages des technologies génomiques pour incorporer des informations commerciales croisées dans le processus de sélection des noyaux. Un récent rapport technique de Genesus sur le microbiome intestinal a décrit un projet lié à la résilience aux maladies du porc dans lequel le microbiome intestinal est également une composante. S'ils sont économiquement importants, ces caractères seront inclus dans les futurs indices de sélection. En plus des caractères impliqués dans la mesure directe et indirecte de la performance des porcs, un nouvel ensemble de données appelé «données Omics» est en cours de collecte à partir d'études de biologie fonctionnelle. Des exemples sont des informations sur les gènes exprimés dans des tissus spécifiques à différents stades de développement, la structure des protéines, le statut de méthylation, l'interaction des éléments régulateurs, etc. Toutes ces données peuvent être utilisées comme de meilleurs prédicteurs pour identifier un porc meilleur et plus robuste. Genesus suit de près ces domaines et participe à de nombreux projets de recherche menés dans ce domaine dans diverses universités de recherche au Canada et aux États-Unis. S'ils sont jugés économiques, ces «traits» seront inclus dans les programmes de sélection de routine à l'avenir.
Catégorisé dans: DERNIÈRES NOUVELLES, Tech mondial
Cette publication a été écrite par Genesus