Integridad de datos y sistemas de evaluación genética

Por: Everestus Akanno, PhD., Genetista, Genesus Inc.

El éxito de los programas de mejora genética porcina depende en gran medida de la generación, recopilación y análisis continuos de datos de toda la industria, tanto del núcleo como del entorno comercial.

Estos datos provienen de una variedad de fuentes que incluyen instalaciones de prueba de progenie, plantas de empaque, núcleos y graneros comerciales, y laboratorios de ADN (Fig.1) que generalmente se caracterizan por un entorno de trabajo acelerado donde la generación y recolección de datos ocurren de manera rápida y continua y es posible que las personas no tengan la precisión de los datos como su máxima prioridad, creando así espacio para posibles errores. Además, los avances en tecnología y computación han permitido la automatización de la generación de datos y la integración en una base de datos remota que puede reducir los errores potenciales. No obstante, todavía existen dudas sobre la calidad y validez de los datos de toda la industria para comparar cohortes, evaluar el mérito genético y tomar decisiones de selección.

¿Qué es integridad de datos?

En el contexto de los programas de mejoramiento genético, la integridad de los datos se define como la medida en que los datos recopilados sobre un individuo son completos, consistentes, precisos y confiables para fines de evaluación genética. De acuerdo con las pautas proporcionadas por el Consejo Internacional de Registro de Animales (ICAR, 2018), un registro completo y preciso de un animal debe tener los siguientes atributos:

Identificación del animal: el animal debe identificarse adecuadamente utilizando cualquier método de identificación adecuado.
Verificación de la paternidad: la paternidad de la persona debe ser verificada y rastreada.
Fechas de registro: las fechas de nacimiento y las fechas de las mediciones deben ser completas y precisas.
Valores fenotípicos: el valor del registro animal de producción o nivel de rendimiento debe estar dentro de las líneas de base publicadas permitidas para los rasgos y la raza.
Efectos sistemáticos: los factores que se sabe que están asociados con el registro de desempeño de un individuo deben anotarse y documentarse adecuadamente.

Problemas con la integridad de los datos en la producción porcina

La recopilación e interpretación de datos forman la base de las muchas decisiones que se toman en la industria porcina. La generación de cantidades significativas de datos se ha convertido en una parte normal del negocio de mejora genética porcina, especialmente con el advenimiento de la tecnología genómica. Sin embargo, los errores humanos y las fallas de los sistemas automatizados pueden comprometer la integridad de los datos. Los ejemplos de problemas potenciales con la integridad de los datos incluyen, entre otros, los siguientes:

Etiquetado incorrecto de muestras (por ejemplo, con fines de genotipado).
Manipulación deficiente de las muestras durante el almacenamiento que puede resultar en la pérdida de datos.
Identificación incorrecta del animal.
Asignación incorrecta de paternidad.
Error en la entrada de datos.
Fallas en los sistemas de medición automatizados que dan lugar a mediciones inexactas o interrupciones en las mediciones cronometradas (por ejemplo, equipos individuales de ingesta de alimento).
Grabación de ultrasonido inexacta de técnicos sin experiencia o sin formación

Los esfuerzos para mitigar estos problemas contribuirán en gran medida a mejorar la calidad e integridad de los datos utilizados para la evaluación genética, lo que conducirá a una estimación más precisa del mérito genético.

Medidas para mejorar la integridad de los datos en los sistemas de evaluación genética

Como se señaló anteriormente, los errores en la asignación de parentesco y en la vinculación de los datos (genotipo o fenotipo) con los animales correctos en el sistema de registro pueden ser muy desastrosos y socavar el poder predictivo del sistema de evaluación genética. La clave más importante para la integridad de los datos son las personas. El personal que tiene un gran interés y comprensión de la importancia de los datos de calidad es el recurso más valioso para garantizar la integridad de los datos. Por lo tanto, la integridad de los datos debe ser monitoreada con frecuencia vigilando de cerca las siguientes áreas:

Los datos de diversas fuentes deben verificarse e interrogarse antes de integrarse en la base de datos.
Todo el software que admite la recopilación de datos, el procesamiento de datos y la presentación de informes de datos debe validarse periódicamente.
El acceso a la base de datos debe estar restringido a las personas responsables de la recopilación y gestión de datos.
Todas las personas involucradas en la recopilación y el análisis de datos deben recibir capacitación y mantener la certificación, según corresponda.
Se deben implementar y automatizar medidas de control de calidad para identificar posibles errores en la entrada de datos.
El uso y análisis de datos debe incluir pasos para identificar, visualizar y filtrar datos erróneos.

Como empresa líder mundial en genética porcina, Genesus Inc. se toma muy en serio la integridad de los datos. Nuestro personal dedicado considera la integridad de los datos como la máxima prioridad. Monitoreamos continuamente la integridad de los datos y hemos establecido medidas para identificar y evitar que los datos erróneos ingresen a la base de datos. Además, el equipo genético de Genesus investiga y desarrolla continuamente enfoques novedosos para mejorar la calidad de los datos utilizados en la estimación del mérito genético, entregando así la mejor genética a nuestros clientes.